På den anden side, Windows har en monolitisk konstruktion, hvorved det skaber en slags afhængighed mellem de forskellige dele af serveren. Et praktisk eksempel kan ses i Windows Media Player og Microsoft Internet Explorer. I tilfælde af Linux, er det kendt for sin open source udvikling af lokalsamfundet. På grund af sin gruppe tilgang metode, kan Linux nemt modsætte sig monolitiske baseret design koncept ved at skabe et operativsystem, der består af dele, der er frit uafhængige af hinanden.
Linux og vinduer kan med held køre populære web teknologier som HTML, CSS DHTML, XHTML, XML, Java Script, JAVA, CGI og Perl. De kan også støtte Email, FTP, rapportering og andre basale funktioner også. Desuden kan begge operativsystemer (Linux og Windows) gør et godt stykke arbejde, når det kommer til samspil med Microsoft forsiden. Linux beskæftiger sig med open source udvikling metode, såsom PHP nad Ruby on Rails. For det meste de Linux-baserede databaser bruge MySQL. På den anden side, vinduer håndtere ASP og andre Microsoft proprietære applikationer såsom Microsoft udveksling.
Window baserede databaser meste er afhængige af MS SQL. Når det kommer til at tale om de sikkerhedsrisici, der er involveret på servere, skal man være opmærksom på, at man ikke kan sikre en 100% risiko frit sikkerhedstjeneste. Jeg siger dette, fordi selv i dag findes der ufaglærte server administratorer; mennesker involveret i brute force password crackere, usikrede PHP eller ASP scripts etc. I en windows-baseret system, bliver det nemt for hackere at gå på kompromis og hele serveren. IIS webserver er dybt forbundet med kernen af vinduerne.
Derfor, hvis en sikkerhedstrussel findes i IIS-webserver, kan det føre til at kompromittere hele windows server. Det er grunden til, eksterne browsere som Mozilla, Fire Fox anses for at være sikrere for et vindue PC end den integrerede Microsoft Internet Explorer. Nu i tilfælde af et Linux sikkerhed baseret system, der er stor samt en uddannet sikkerhed team. Dog skal man også være op