Eugene analyserer virus og udvikler moduler for første gang virus desinfektion.
Siden da begyndte han at samle ondsindede programmer og moduler til desinfektion af disse vira. Samlingen blev senere grundlaget for antivirus-database kaldet Kaspersky Antivirus. I øjeblikket databasen har 1,3 millioner plader og er en af verdens mest omfattende antivirus-databaser. I 1991 Eugene sluttede den amerikanske Informationsteknologier Center, hvor Eugene og hans kolleger har udviklet en gruppe af AVP antivirus-projektet, der blev den grundlæggende form for Kaspersky Antivirus.
Verden anerkendelse til projektet i 1994, hvor AVP ikke er kendt for at have vundet en konkurrence arrangeret af Hamburg Universitet laboratorieforsøg, der viser, at virus opdagelse sats er højere end de mest populære antivirusprogrammer på det tidspunkt. Så i 1997, Eugene og co-partner besluttet at etablere et selvstændigt selskab, som senere blev grundlæggeren af Kaspersky Lab. Siden da, Eugene leder af anti-virus forskning selskab. Indtil endelig, i 2007, er placeret som den administrerende direktør Eugene Kaspersky Lab.