Hans søn Humayun besteg tronen i 1530, og i 10 turbulente år, han regerede fra Delhi. I 1533 fejrede han etableringen af hans dynasti ved at bygge en ny by, Dinpanah. Sitet blev nøje udvalgt på bredden af Yamuna. Ingen spor af byen nu tilbage, da det blev fuldstændig ødelagt af Sher Shah Suri. De næste to Mughal herskere Akbar og Jahangirs foretrak at regere Indien fra Agra, men indse betydningen af Delhi, betalte hyppige ceremonielle besøg i byen. I 1639 Shah Jahan instrueret sine ingeniører, arkitekter og astrologer til at vælge et sted med et mildt klima sted mellem Agra og Lahore.
Valget var Hazrat Delhi i sultaner, på den vestlige bred af Yamuna, lige nord for Purana Qila. Shah Jahan startede opførelsen af den nye hovedstad i første omgang, med fokus på hans fort kaldet urdu-i-Mualla. Populært kaldet Lal Qila, eller Det Røde Fort blev afsluttet i otte år, og den 19. april 1648 Shah Jahan indtastet hans fort, og hans nye hovedstad, Shajahanabad, fra flodbredden porten.
Fortet havde en monumental indgang, Lahori Gate, hvorfra opstod hovedgaden i byen, slutter ved Fatehpuri moskeen.
Den Jama Masjid, påbegyndt i 1644, og byen muren, bygget mellem 1651 og 1658, var de næste vigtigste strukturer til at være afsluttet i byen. Muren var halvrunde, 8 m høj, 3,5 m tyk, og 6 km lang, og lukkede et område omkring 6,4 kvadratkilometer. Den blev præget med syv store porte (Kashmir, Mori, Kabuli, Lahori, Ajmeri, Turkomani og Akbarabadi), og væggen frontmand floden havde tre porte (Raj Ghat, Qila Ghat, og Nigambodh Ghat). Byen Delhi videre til hænderne på briterne i 1803 e.Kr.. Det var først i 1911, da hovedstaden i britiske imperium blev flyttet fra Calcutta til Delhi.
I januar 1912 en tre-medlem komité blev dannet for at "arbejde om de praktiske detaljer i politicaldecision". Det havde som medlem arkitekten Sir Edwin Lutyens, som var i sidste ende at give form til byen. Udvalget satte sig for at vælge et websted. Den Raisina bakke lig