Bevarelse af miljøet, at opretholde en økologisk balance og bevare over tres procent af jorden under skovdække som et spørgsmål om politik, er spørgsmål, der er givet højeste prioritet ved Bhutans regering. Dette er en unik funktion i styringen for et lille land, der er i klubben mindst udviklede lande
Bhutan er usædvanlig rig på flora og fauna for et land dets størrelse
Over tre hundrede og halvtreds arter af medicinske planter er blevet identificeret i hele landet.
Disse planter er til stor nytte og interesse for de forskellige School of Medicine ayurvedisk, bhutanesiske, kinesisk og tibetansk. Disse skoler medicin kommer under parolen "Alternativ medicin". Himalaya i almindelighed og Bhutan i særdeleshed er kendt for at være rig på lægeurter og planter fra det tidligste tidspunkt, som har beriget de ældste skoler af medicin. Bhutan var på et tidspunkt navngivet Rige Healing urter og også Lotus Garden of the Gods rig på skove af sandeltræ og søde duftende urter.
Blomster fra Bhutan er godt accepteret i Europa, og adskillige arter har været introducere i Danmark Frankrig, Tyskland, Schweiz og visse andre lande samt
Den anerkendte liste over orkideer i verden er blevet beriget ved inddragelse af nogle af de bhutanske arter, som vokser i ideelle omgivelser. Nabolandet sikaim har 454 arter, som vokser i et ideelt miljø territorium. Den vifte af liljer er blevet beriget videre med identifikation af Dzuko lilje på og omkring grænserne til Bhutan Omkringliggende Arunachal Paradesh.
En bred vifte af nåletræer er synlige overalt, hvor vegetationen kan finde sted, og er godbid at studere sammen med savannen og andre former for græs. Og buske vrimler og de gøer af Daphne er kilden til papirfremstilling.
Bhutan har over hundrede og halvfjerds fem dyrearter blandt hvilke er nogle sats arter såsom taget, gyldne langue og moskus hjorte giver et hjem til nogle af de truede arter af dyr og fugle, der er 36 vilde arter der er truede i henhold til FN-statistik