Efter at have besejret de første par chefer, begge disse strategier fortsætte med at arbejde indtil slutningen af spillet. Det gør det ikke nemmere, men det vil gøre dem mere surprising.Regular fjender Alpha Protocol har varieret AI. Spillet er ekstremt Intel ekspansion netværk giver spilleren mulighed for at lære, hvordan hver type fjende er god. Nogle fjender er afhængige af stealth og flankerende teknikker, mens andre er stærkt pansrede, bruger granater, og forsøg på at direkte betalinger og banke afspilleren fra hans fødder.
At være udelukkende til mennesker, der bruger pistoler udelukkende, gjort overraskende i stand til at holde tingene varierede. Således er der kun så meget variation mellem kroppen rustninger og våben, så der er nogle gentagelser i fights.Customization En vigtig komponent i et RPG er evnen til at tilpasse din karakter (e). Opgørelsen systemet er designet godt. Spilleren får lov til at bære to våben hver mission, hans valg af skudsikre veste, og en række af gadgets. Våben har fire slots opgradering (såsom dækningsområder og lyddæmpere).
Krop armors med variable mængder af opgraderingsmuligheder, som har bedre armors har flere slots. Krop rustning opgraderinger kan give mere panser omkostningerne ved at være mere støjende, eller give interessante gameplay ændringer som at spilleren ikke kan påvises ved kameraet i en kort periode time.level af hver spiller får AP at bruge på færdigheder.
Der er bekæmpe orienterede, stealth orienterede, orienterede gadgets og andre diverse skill points til at investere i alle tegnene kan investere skill points i nogen af deres valg på et vist niveau, men kun visse klasser kan mestre deres færdigheder. Man kan ikke beherske commando stealth, men han kunne beherske geværer. En spion kan mestre kampsport, men han kunne ikke beherske sabotage. Den commando kan stadig investere store mængder af punkter i tyveri, men de bedste kapaciteter for tyveri er ikke tilgængelig.
Det er opmuntrende tegn, de