De vigtige elementer i de naturlige søer er geografisk placering, og størrelsen og formen af bassinet. Der er fem typer af naturlige søer, og de er ørredsøer, to-etagers søer, sandart søer, bas-panfish søer og roughfish søer.
ørredsøer er meget dybe og kolde. De har en meget lav fertilitet. De fleste ørredsøer har klippefyldte bassiner og er normalt fyldt med strøm ørred og naturlige sø ørred.
To-etagers søer er langt mere frugtbar end ørredsøer. To-etagers søer har bassin af sten, grus og sand. Dette hjælper moderere væksten af ukrudt.
I dybden af to-etagers søen er ørred, coolwater fisk, warmwaterfish, walleyes og smallmouth fisk.
Walleye søerne er for det meste frugtbar. Sandart søer bassiner er sandet med grus og sten. Ukrudt vækst i en sandart sø er moderat. Den sandart sø indeholder varmtvandsanlæg fisk, coolwater fisk, walleyes, nordlige gedde, bas, og panfish.
Bas-panfish søer er for det meste frugtbare med en masse af ukrudt. Bass-Panfish søer indeholder largemouth bas, klumpfisk, nordlige gedde, og walleyes.
Roughfish søer er meget frugtbare søer, og de har lidt sand eller grus.
Planter vokser kun i den lavvandede del af roughfish søer. Disse søer indeholder bullheads, karper, bas og panfish.
Naturlige søer spænder fra at være frugtbare for ufrugtbar. I nogle naturlige søer vandet bliver for overfladisk for fisk. Denne proces kaldes aldring og det tager thosands år for at dette kan ske. Frugtbare søer er som regel omgivet af meget rige jord. Dette tilføjer en meget stor mængde af kvælstof, og andre gødningsmaskiner elementer til søen.