Det samme kan ikke siges for kulisser desværre.
Gem for en håndfuld landemærker som Central Park og Times Square, meget af Prototype Manhattan begynder at se det samme efter et stykke tid, og fordi hele øen er din til at udforske fra get-go, det aldrig ændringer. Med det sagt, flytte rundt på øen er så sjovt som Mercer, som du uundgåeligt ender med at udforske alligevel, og der er 200 glødende kugler til at finde rundt i byen for at opfordre dig til at gøre det. Der er en række andre ting at gøre uden for historie-missioner så godt.
Valgfri timet og score udfordringer omfatter checkpoint kørsler på tværs af tagene, kampe, hvor du skal forblive forklædt som soldat og brug kun konventionelle våben, svæveflyvning mod mål og forsøger at lande i midten, helikopter angrebsflugter, og meget mere.
Memories stjålet fra andre karakterer gør Prototype historie mørkere og mere interessant.
Måske de mest interessante udfordringer er dem, hvor du har en frist til at forbruge en række fremhævet fodgængere i forskellige områder af byen.
Disse fodgængere, om hvem der er mere end 130 for at finde både under udfordringer og under almindelig leg, er specielle, fordi de hver især har en vis viden om, hvad der foregår i Manhattan, og når du spiser dem, er du behandlet til en kort montage af deres relevante minder. Kun få af disse indeholder mange oplysninger hver for sig, men de er slickly præsenteret, og oplåsning et stort antal af dem tilføjer et ekstra, mørke lag til det til tider forudsigelig historie, der er indsatsen værd.
Tilsvarende, hvis du vælger at infiltrere militærbaser og forbruge specialiserede soldater inde, kan du lære evner fra dem (hvordan at flyve en helikopter, for eksempel) eller forbedre din effektivitet med kanoner. Prototype kernefortælling missioner kan blive slået i mindre end 10 timer, men du kan mageligt fordoble dette nummer på din første play-through hvis du ikke er i en rush og tage sig tid til at tjekke alle de ekstraudstyr.