Som en katolsk University, Ateneo de Manila søger at danne personer, der efter de lærdomme og eksempel Kristi, vil vie deres liv til at tjene andre, og ved at fremme retfærdighed, tjener især dem, der er mest behov for hjælp, de fattige og de magtesløse.
Loyal til læren i den katolske kirke, University søger at tjene tro og til at fortolke dens lære moderne filippinske samfund.
Som en Jesuit University, Ateneo de Manila søger målene for Jesuit liberal uddannelse gennem harmonisk udvikling af moralske og intellektuelle dyder. Gennemsyret af Ignatian ånd, universitetet har til formål at føre sine elever til at se Gud i alle ting, og at stræbe efter større Guds ære og større tjeneste for menneskeheden.
Universitetet søger alle disse, som en akademisk samfund, gennem udøvelsen af de funktioner, rette til et universitet, der er, gennem undervisning, forskning og service til samfundet.