Den biologiske oplysninger kan lagres i forskellige databaser. Hver database har sin egen hjemmeside med unikke navigation værktøjer. De biologiske databaser er generelt offentligt tilgængelige.
De kan inddeles i
Nukleotidsekvensen oplysninger, som forskerne og genom sekventering grupper på databaserne nemlig GenBank, EMBL Europæiske Molekylærbiologiske Laboratorium, og DNA data Bank of Japan. Dette er en god database, som de synkroniseres på daglig basis.
Nucleotidsekvenserne er tilgængelige i form af cluster repræsenterer gener er tilgængelige i disse banker. Også oplysninger om komplette genomprojekter er tilgængelige. Udover de primære nukleotid-databaser, er der nogle andre databaser også at give oplysninger om gener, genomer og igangværende forskningsprojekter.
Disse er normalt fremstillet af den eksisterende litteratur og i samråd med eksperterne. I fakta, databaser der repræsenterer de oversatte DNA-databaser.
For eksempel schweizisk PROT indeholder en beskrivelse af strukturen af et protein, dets domæner struktur, dets domæner struktur, post translationelle modifikationer, varianter etc. Det har høj grad af integration med andre databaser og minimalt niveau af redundans. Det har også mønstre og profiler til sekvenser og biologiske funktioner.
De tre dimensionelle strukturer af makro molekyler bestemmes af røntgen krystallografi og nuklear magnetisk resonans. FBF og SCOP er de primære databaser af 3 D strukturer af biologiske molekyler.
Kegg database er en vigtig en, der giver oplysninger om den aktuelle viden om molekylærbiologi og cellebiologi med særligt henblik på information om metaboliske veje, interagerende molekyler og gener.