I mellemtiden Thel 'Vadamee er teleporteret til nær Halo kontrol værelse. Der finder han mange døde Elites, som var uden tvivl dræbt af Brutes. Med hjælp fra et par udsendte Elites, og sympatiske Grunts og jægere, han kæmper sig vej til at opfylde RTAS 'Vadumee, der er overrasket over at høre, at Brutes myrdede rådsmedlemmerne. De kæmper deres vej til en skarabæ, hvor sergent Johnson afholdes.
Johnson tager kontrol over Scarab og kraftigt indleder en usikker alliance mellem mennesker og de Elites. Med en samlet indsats fra Johnson og "Vadamee, Scarab overtræder kontrolrummet dørene ved at bruge den vigtigste energi kanon på Scarab, og" Vadamee kommer ind Control Room at konfrontere Tartaros. I kontrolrummet, han hører sandheden af glorier direkte fra 343 Guilty Spark. Stadig blændet af tro, Tartaros tvang Miranda Keyes at aktivere Halo. Mange zeloter og Byrådsmedlemmer støtte «Vadamee i hans sidste kamp mod Tartaros, og til sidst efter en lang og hård kamp lykkedes at dræbe ham.
Når Tartaros er besejret, Miranda griber indekset lige i tide til at stoppe Halo fra fyring. 343 Guilty Spark siger dog, at det har aktiveret en fejlsikker protokol, hvilket får Installation til at sende et signal til resten af Halo Array, sætte dem på standby for fjernbetjening af denne fra Arken.
Forerunner Dreadnought ankommer til Jorden med SPARTAN-117 ombord. Han advarer admiral Hood af hans tilstedeværelse, og fortæller ham, at han er "færdig med denne flyvning".
I en scene efter de kreditter, fremgår det, at Høj Charity
er blevet fuldstændig overtaget af syndfloden, som tusindvis af Flood sporer er synlige i hele luften, svævende langs visningen. Den Gravemind taler om tilfredshed er fri af hans "tomme grav", og pludselig Cortana vises som et hologram på en piedestal i rummet. Den Gravemind da, at der er spørgsmål, som hængende i hans sind, som Cortana skal besvare. Cortana svarer: "Okay ... skyde." Skærmen derefter bliver sort, før ethvert spørgsmål høres.