Darwin foreslog, at arter tilpasser sig deres miljø gennem lange perioder, i forhold til et menneskes levetid, og med tid nok ville forklare mangfoldigheden af organismer i verden. Denne tilpasning til miljøet, hvad der er tilladt liv at overleve og sprede sig over hele verden. Men selv om forskerne i dag erkende dette fænomen, mekanismerne bag miljøtilpasning er stadig relativt nyt og ukendt. For at forstå denne mekanisme for tilpasning, en 57 år lang eksperiment blev afholdt.
En Drosophila melanogaster (bananfluen) linje var racen for 1400 generationer under en betingelse for noget lys. Analysen af genomet af fluer i dette forsøg viser, at fluerne yngler i mørket udviklet en tilpasning, der udviser højere frugtbarhed i mørke end i lys. Det betyder, at fluerne født fra generationer af fluer yngler i mørket havde en fordel, når avl i mørke, en tilpasning til mørket udviklet, og forskerne har sporet af tilpasningen af mutation af gener, der koder en olfaktoriske receptor og en let receptor. I undersøgelsen af 1400 generationer af fluer, ændringer i genomet blev fundet med sammenligning af de eksperimentelle fluer og kontrolstammen. Ca. 220.000 single nukleotid polymorfier (SNP) og 4.700 indsættelser og sletninger (indels) blev identificeret. Selv om disse tal ser ud til at være utrolig stor de fleste af ændringerne i genomet var synonyme SNPs. Selv med disse ændringer i genomet, aminosyrerne og proteiner, der blev kodet var uændrede. Kun 1,8% af de identificerede SNPs blev klassificeret som ikke synonym (nsSNPs). Disse nsSNPs ændret aminosyresekvens af genprodukt. En ændring af aminosyresekvensen har potentialet til at ændre proteiners struktur og funktion fører til dannelsen af nye proteiner. De små kumulative nsSNPs fører til små fænotypiske udtryk forskellige fra kontrolgruppen. Disse genændringer præsentere en sag for udviklingen af en art gennem tilpasning med årsagen til selektivt pres. Den miljømæssige selektivt pres stede i eksperimentet var et miljø af mørket. Til fluerne betyder det, at hvis de ønskede at være den stærkeste, den bedste til at producere frugtbare afkom, de havde brug for at være i stand til effektivt at reproducere i mørket. Dette tryk vil bevirke, at populationen af fluer at favorisere specifikke fluer. Disse fluer ville videregive deres genetiske information. Mutation ville ske over mange generationer, og i dette tilfælde 1400, og de mutationer, der er fastsat en fordel for det sele
Udviklingen i NLP