Et hypofysen problem kunne være en anden årsag til fraværet af menstruationscyklus sammen med problemer i hypothalamus. Dette problem kan behandles med medicin til forhåbentlig løse hvad der foregår i hypofysen.
Der er nogle gange en abnormitet i kromosomer. Dette påvirker produktionen af folliklerne sammen med æg, som forårsager en kvindelig at få ægløsning. Dette problem har ingen løsning.